دانشکده علوم پایه از بدو تاسیس دانشگاه فعالیت آموزشی خود را آغاز نموده و در حال حاضر در کنار توسعه رشته های ریاضی و فیزیک مسئولیت ارائه دروس علوم پایه را به عهده دارد. پذیرش دانشجو در این دانشکده با رشته های ریاضی و فیزیک در مقطع کارشناسی ارشد به ترتیب در سالهای ۱۳۸۳ و ۱۳۸۴ آغاز گردید. هم اکنون در همه مقاطع تحصیلی این رشته ها پذیرش دانشجو انجام می پذیرد.